La iniţiativa Ministerului Fondurilor Europene a fost realizat şi publicat Ghidul privind principalele riscuri identificate în domeniul achiziţiilor publice şi recomandările Comisiei Europene ce trebuie urmate de Autorităţile de Management şi Organismele Intermediare în procesul de verificare a procedurilor de achiziţii publice. Ghidul a fost adoptat prin Ordin comun al Ministrului Dezvoltării Regionale şi Administraţiei Publice, al Ministrului Mediului şi Schimbărilor Climatice, al Ministrului Economiei, al Ministrului Muncii, Familiei, Protecţiei Sociale şi Persoanelor Vârstnice, al Ministrului Transporturilor, respectiv al Ministrului Fondurilor Europene.
Pentru a îndrepta greşelile din perioada 2009 – 2011, Guvernul României a decis să suporte de la bugetul de stat contravaloarea corecţiilor financiare aplicate de Comisia Europeană pentru instituţiile publice finanţate în cadrul Programului Operaţional Regional, respectiv pentru operatorii de apă şi alţi beneficiari din cadrul Programului Operaţional Mediu.